Roche a IBM spolupracují na vývoji technologie sekvenování DNA

Nová technologie vyvinutá divizí IBM Research umožňuje sekvenování jednotlivých molekul DNA procházejících nanometrickým pórem v křemíkovém čipu. Tento přístup slibuje výrazné výhody z hlediska nákladů, šíře aplikačního použití a rychlosti oproti technologiím sekvenování,které jsou v současné době k dispozici nebo ve vývoji.

„Spojením schopností na poli výpočetní biologie, biotechnologie a nanotechnologie se blížíme k vytvoření systému, který dokáže rychle a přesně převádět informace uložené v DNA na lékařsky relevantní genetické informace,“ uvedl Ajay Royyuru, senior manažer oddělení výpočetní biologie v divizi IBM Research. „Výzvou u všech technologií sekvenování založeného na nanopórech je zpomalení a kontrola pohybu sekvenované DNA nanopórem. Proto vyvíjíme takovou technologii, která tuto kontrolu pohybu DNA nanopórem umožní tak, aby čtecí zařízení mohlo přesně dekódovat sekvenci DNA.“

Tato technologie má díky vysoké sekvenační kapacitě a snížení nákladů potenciál naplnit vizi osekvenování celého lidského genomu jednotlivce za cenu od sta do jednoho tisíce dolarů. Snadný přístup ke genomu jednotlivce by mohl umožnit personalizaci lékařské péče v šíři, o které v tomto okamžiku můžeme pouze snít.

„Sekvenování je čím dál tím důležitějším nástrojem pro personalizovanou medicínu. Může poskytnout individuální genetické informace nezbytné pro efektivní diagnostiku a cílenou léčbu chorob,“ vysvětlil Manfred Baier, ředitel Roche Applied Science, jež je součástí skupiny Roche. „Jsme přesvědčení, že tato účinná technologie v kombinaci s vysokou odborností IBM a
Roche přinese levné a přesné sekvenování celého genomu se všemi jeho přínosy na trh rychleji, než se dříve považovalo za možné.“

V rámci dohody bude Roche financovat další vývoj technologie v laboratořích IBM a prostřednictvím spolupráce se svou dceřinou společností 454 Life Sciences, která se na sekvenování specializuje v rámci skupiny Roche, poskytne také další zdroje a odborné znalosti. Roche bude následně vyvíjet a prodávat všechny produkty založené na této technologii.

Investice společnosti Roche do genomických technologií budoucnosti staví na síle současných sekvenačních systémů 454, které generují stovky tisíc dlouhých, vysoce kvalitních sekvenačních čtení v řádu hodin. Pro genomickou analýzu ve velkém měřítku je tato technologie k dispozici na přístroji GS FLX System (dva takové systémy pracují i v České republice) a pro střední laboratoře je k dispozici GS Junior System uvedený na trh v EU v květnu tohoto roku. Sekvenační systémy 454 prokázaly a prokazují významnou lékařskou hodnotu v aplikacích cíleného resekvenování pro virologický a onkologický výzkum a jako
takové budou první technologií právě nastupující generace sekvenování, která se dostane z laboratoří do praktického použití ve zdravotnictví.

Další informace o sekvenčních systémech 454 najdete na webu www.454.com.