Pro používání služby Mega je v současné chvíli vhodný pouze Microsoft Internet Explorer a prohlížeč Chrome od Google, jiné prohlížeče nepodporují totiž všechna potřebná HTML5 API. Přesto služba doporučuje používat zatím pouze Chrome.
Internet Explorer 10 sice podporuje všechna HTML5 FileSystem API, jenž má to jeden háček, chybí mu zatím podpora ukládání datových objektů přímo na disk (Blob a FileWriter API). Důsledek je ten, že každý stažený soubor díky dvojímu ukládání na disk tak alokuje (dočasně) dvojnásobnou velikost.
Další související chyba ukládání v Blobu způsobuje, že se paměť sama neuvolňuje, takže je záložku se službou Mega potřeba zavírat a obnovit po každých pár stech MB stažených souborů. Slabou útěchou může být uživatelům výkon JavaScriptu, který je pro změnu znatelně rychlejší, než v aktuální verzi Chrome.
Službu Mega lze nouzově provozovat také v prohlížečích jako je IE 9, Firefox, nebo Safari, řada technologií zde ale není podporována, čímž servis ztrácí většinu své elegance. Asi nejhůře je na tom Opera, která nezvládá efektivně provádět kryptografické operace potřebné pro šifrování přenosu souborů a stává se tak prakticky nepoužitelnou.